无细胞蛋白表达技术是一种先进的体外重组蛋白质表达技术,是利用含有蛋白质合成必需组分的细胞裂解物,在体外条件下进行蛋白质合成的过程。这些必需组分通常包括核糖体、转运RNA(tRNA)、氨酰合成酶、启动/延伸/终止因子、三磷酸鸟苷(GTP)、ATP、Mg2+和K+等。该技术通过在体外模拟细胞内的蛋白质合成环境,实现了不依赖于完整细胞体系的蛋白质生产。
无细胞蛋白表达技术是一种在体外模拟蛋白质合成过程的技术,不依赖完整的细胞结构。以下是使用该技术时需要注意的一些关键事项:
一、模板DNA方面
纯度要求
模板DNA的纯度对无细胞蛋白表达至关重要。如果模板DNA含有杂质,如蛋白质、RNA、有机溶剂等,可能会干扰无细胞翻译系统的反应过程。例如,残留的蛋白质可能会与无细胞系统中的酶竞争底物,或者影响酶的活性。一般要求模板DNA的纯度达到较高的标准,A260/A280比值通常在1.8-2.0之间,以确保模板DNA的质量。
需要通过合适的纯化方法,如酚-氯仿抽提、乙醇沉淀等,去除杂质,以获得高质量的模板DNA用于后续的无细胞表达。
浓度优化
模板DNA的浓度需要合理调整。浓度过低可能导致蛋白质产量低,因为参与翻译的模板数量有限;而浓度过高则可能会引起模板之间的相互干扰,或者使反应体系的黏度增加,影响物质的扩散和反应效率。
不同的无细胞表达系统对模板DNA的优浓度要求不同,一般需要通过预实验来确定。例如,对于某些基于大肠杆菌裂解物的无细胞表达系统,模板DNA的浓度可能在50-200 ng/μL之间较为合适。
二、原料供应方面
氨基酸供应
确保无细胞系统中有足够且平衡的各种氨基酸是关键。缺乏任何一种必需氨基酸都会导致蛋白质合成不完整或产量降低。
有些特殊的氨基酸,如硒代半胱氨酸,在某些蛋白质的合成中是必需的,但在常规的氨基酸混合物中可能不存在,这时需要另外添加。同时,氨基酸的浓度也会影响蛋白质表达,过高的氨基酸浓度可能会抑制反应,因此需要根据具体的表达系统和蛋白质进行优化。
能量物质供应
无细胞蛋白表达需要能量物质来驱动反应,通常是三磷酸腺苷(ATP)和还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)。ATP为蛋白质合成提供能量,包括肽键的形成、氨基酸的激活等过程都需要ATP参与。NADPH主要参与一些需要还原环境的步骤,如二硫键的形成等。
这些能量物质的浓度需要维持在合适的水平。如果ATP浓度过低,蛋白质合成会因为能量不足而受阻;如果浓度过高,可能会导致系统的渗透压改变,影响反应的正常进行。一般会根据无细胞系统的特性和反应规模来确定能量物质的添加量。
三、反应条件控制方面
温度控制
温度对无细胞蛋白表达中的酶活性有显著影响。不同的酶在无细胞系统中有其最适反应温度。一般来说,无细胞表达系统的反应温度在室温(20-25°C)到37°C之间。温度过低,酶的活性会降低,蛋白质合成速度变慢;温度过高则可能导致酶变性失活。
例如,对于一些来源于大肠杆菌的无细胞表达系统,37°C可能是比较合适的温度,但这个温度也可能会加速系统的蒸发和成分的降解,所以需要在反应过程中通过合适的设备(如恒温水浴、金属加热块等)精确控制温度。
pH值控制
pH值会影响蛋白质的电荷状态和酶的活性。无细胞蛋白表达系统通常有一个最适pH范围,一般在7.0-8.5之间。不适当的pH值可能会导致氨基酸的离子化状态改变,影响翻译过程中的氨基酸活化和肽链延伸。
同时,pH值的变化还会影响无细胞系统中各种酶的活性,例如,负责蛋白质折叠的分子伴侣在不适当的pH条件下可能无法正常发挥功能。可以通过添加缓冲液(如Tris-HCl、HEPES等)来维持反应体系的pH稳定。
离子强度控制
离子强度对无细胞蛋白表达也有重要影响。合适的离子强度可以维持蛋白质和核酸的结构稳定性,促进酶与底物的结合。
过高的离子强度可能会屏蔽分子间的电荷相互作用,干扰反应;过低的离子强度则可能导致蛋白质和核酸的聚集或沉淀。通常通过添加适量的盐(如氯h钾、氯化钠等)来调节离子强度,使其适应无细胞表达系统的要求。
四、抑制因素方面
内源核酸酶抑制
无细胞系统中可能存在内源核酸酶,这些核酸酶会降解模板DNA和mRNA,从而降低蛋白质表达的效率。为了防止这种情况,需要添加核酸酶抑制剂,如RNasin(用于抑制RNA酶)和某种DNA酶抑制剂。
不同的无细胞系统可能需要不同类型和浓度的核酸酶抑制剂。例如,在一些植物无细胞表达系统中,由于植物组织本身含有较多的RNA酶,可能需要添加较高浓度的RNasin来有效抑制RNA降解。
蛋白酶抑制
无细胞系统中也可能含有蛋白酶,这些蛋白酶会降解新合成的蛋白质。添加蛋白酶抑制剂(如苯j基磺酰氟(PMSF)、乙二胺四乙酸(EDTA)等)可以保护目标蛋白质不被降解。
但是,蛋白酶抑制剂的使用需要谨慎,因为某些抑制剂可能会对无细胞系统中的酶产生非特异性抑制。在选择蛋白酶抑制剂时,需要考虑其特异性和对无细胞系统的兼容性。